2004年8月，學校整體從軍隊移交四川省政府，更名為“成都醫學院”，進入國民高等教育行列，成為獨立設置的醫學本科院校。
　　2011年7月，學校被國務院學位委員會確認為碩士學位授予單位，人體解剖與組織胚胎學、病理學與病理生理學為碩士學位授權學科，2012年開始獨立招收碩士研究生。學校辦學層次躍升到研究生教育，站上了新的歷史發展點！
　　轉隸地方后，學校確立了“到2020年，建設成為特色鮮明、優勢突出的醫學高等院校”的發展目標，樹立了“以人為本，開放辦學，質量立校，特色發展”辦學理念，堅持“走創新之路、建特色強校”辦學思路。
　　目前，學校占地面積1200多畝，擁有天回和新都兩個校區。生均圖書館藏書、教學行政用房面積、學生公寓面積、教室面積、每百名學生多媒體教室和語音教室座位數均達國家要求。
　　學校已形成以醫學為基礎，理學、工學、管理學等多學科門類協調發展的格局。設置了基礎醫學院、人文信息管理學院、臨床醫學院、藥學院、檢驗醫學院、護理學院、醫學影像系、生物醫學系、公共衛生系、心理學系、思想政治理論課教學部等11個教學單位，擁有11所附屬醫院（含非直管附屬醫院）。
　　學校現有教職工600余人，其中碩士、博士學位占教師隊伍的68%，副教授、教授等高級職稱占教師隊伍的33%。新增一批享受國務院政府特殊津貼、教育部新世紀優秀人才、省級教學名師、省級學術和技術帶頭人/后備人選等專家。
　　學校開設有臨床醫學、預防醫學、醫學影像學、麻醉學、護理學、醫學檢驗、藥學、藥物制劑、應用心理學、生物技術、公共事業管理學、信息管理與信息系統等12個本科專業，以及醫學檢驗技術、藥學、護理3個專科專業。
　　近五年，學校承擔了包括15項國家自然科學基金、2項國家哲學社會科學基金在內的科研項目320項。獲發明專利授權5項，發表論文2863篇（署名成都醫學院SCI,EI,ISTP收錄76篇）；出版科技學術著作與教材77部。獲得省級教學成果獎、省級科技進步二等獎、省級哲學社會科學獎等9項。
　　近年來，學校承辦國際和國內學術會議7次，與英國中央蘭開夏大學、美國加州高級護理學院合作，邀請美、日等國及國內專家100余人次來校講學或學術交流。
　　學校現有在校學生7000多名。學校培養的學生，專業基礎扎實，綜合素質高，實踐能力強，得到用人單位廣泛好評。畢業學生在碩士研究生、住院醫師、醫師和護士執業資格等各項考核中，均有不俗成績。2010年臨床醫學專業腫瘤方向、生物技術專業學生研究生考取率分別為22%、20%。護士執業資格考試一次性通過率連年保持100%。學校連續3年被評為“四川省普通高校畢業生就業工作先進單位”。
　　戰火紛飛之際，篳路藍縷，以啟山林；雪域高原之時，殫盡竭慮，戍邊衛國；和平發展之時，深謀遠慮，做大做強……64年，學校實現從小到大、由弱到強的壯大；實現從部隊院校到地方高校的轉變；實現從培訓機構到高等院校、從專科高校到碩士學位授予單位的巨大跨越！
　　學校在戰斗中成長，在調整中發展，在改革中前進，譜寫了一曲曲嘔心瀝血、無私奉獻、精心育人的光輝篇章。
　　獲批碩士學位授予單位、新校區全面投入使用，學科專業、師資隊伍、基礎設施等各項工作取得的建設成就，讓成醫站上了新的發展點。
　　風正勁，帆已揚！面向未來，成醫人豪情壯志，信心滿懷。
　　成醫人將繼承部隊優良傳統，發揚“博學博愛，精益求精”的校訓，以學科建設為龍頭、以教學工作為中心、以人才隊伍建設為根本，凝心聚力，搶抓機遇，繼往開來，務實奮進，改革創新，再創輝煌！