（一）指導思想
　　以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導,"深入貫徹落實科學發展觀，堅持黨的教育方針和社會主義辦學方向；積極融入海西建設大局，主動服務區域經濟社會發展；解放思想、開拓進取，創新管理機制、探索發展模式，推進開放辦學、拓展合作交流；遵循高等教育辦學規律，樹立“辦學以教師為本，教學以學生為本”的教育理念，提高人才培養質量，提升科學研究水平，增強服務社會能力；正確處理規模、質量、結構、效益的關系，優化層次結構，凸顯辦學特色，努力實現全面協調可持續發展。
　　（二）辦學定位
　　立足三明，面向海西，輻射全國，把三明學院辦成以培養高素質的應用型人才為主的，在學科建設、人才培養、校園文化方面具有明顯特色的，工學、理學、文學、管理學等多學科協調發展的教學型地方性本科高校。
　　發展目標定位：辦學特色鮮明，居省內先進水平的地方性本科高校。
　　學校類型定位：教學型地方性本科高校。
　　辦學層次定位：以本科教育為主，積極發展研究生教育。
　　人才培養目標定位：培養理論基礎扎實、實踐能力較強、富有創新精神、適應區域經濟社會發展需要的高素質應用型人才。
　　學科專業發展定位：以工、理、文、管學科為主體，多學科協調發展；加強應用性專業建設，重點發展區域經濟社會發展急需專業和新興應用技術專業，鞏固提高教師教育類專業，形成文理滲透、理工管結合、具有時代特征和區域優勢的學科專業結構。
　　服務面向定位：立足三明、面向海西、輻射全國，為三明經濟社會發展、海西建設和科教興國提供人才支持和智力支撐。
　　（三）總體發展目標
　　在全面完成“十一五”規劃、服務海西建設規劃的基礎上，抓住機遇、加快發展，到2020年，把三明學院建設成為特色鮮明、居省內先進水平的教學型地方性本科高校。
　　2010年到2015年，夯實基礎、加快發展階段：辦學規模適度擴大，全日制在校生達到13000人左右，成人高等教育在籍生達到2500人以上；完成由專科向本科的全面轉型，順利通過教育部本科教學工作合格評估;應用型人才培養水平不斷提高，重點學科建設取得較大進展，實現研究生教育的突破；教學改革不斷推進，“質量工程”建設成效顯著，專業建設與人才培養模式形成特色；科研水平加快提升，服務海西重點項目建設成果豐碩，產學研結合不斷深化拓展；師資隊伍結構進一步改善，教學科研團隊建設、學科專業帶頭人培養取得明顯成效；對外合作交流大力推進，合作辦學形成一定規模；校園建設滿足規模發展需要，校園公共服務體系不斷完善，校園文化建設持續推進。
　　2016年到2020年，調整提高、穩步發展階段：全日制在校生達到并穩定在15000人左右，成人高等教育在籍生達到3000人以上；建成特色突出、優勢明顯的應用型人才培養體系，教育教學質量、辦學聲譽明顯提升；學科專業建設長足進步，部分重點學科達到省內同類高校領先水平，研究生教育穩步發展；科研與科技創新能力明顯增強，取得一批較高層次、對區域經濟社會發展影響較大的成果；師資隊伍結構進一步優化，中青年學科帶頭人力量壯大，形成一批高素質、高水平的教學科研團隊；對外合作交流向高水平、深層次發展；辦學條件全面改善，校園文化內涵豐富、特色明顯，辦學實力整體躍升。基本建成特色鮮明、居省內先進水平的教學型地方性本科高校。